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유전체 정보분석 전문가 기본과정 I
Bioinformatics와 NGS 기술의 급격한 발전으로 인간 유전체 데이터에 기반한 개인 맞춤의학의
시대가 성큼 다가왔습니다. 임상 의료정보와 유전체 데이터의 통합분석에서 올바른 바이오-정보-의학적 도구 사용의 중요성은 아무리 강조해도 지나치지 않습니다.서울대학교병원 정밀의료 전문인력 양성과정에서는 급변하는 연구 환경에 대응하고, 유전체 데이터 기반의 맞춤의료 시대를 선도하는 유전체 임상 정보분석 전문가 양성을 위하여, 공개 소프트웨어인 R 통계 package와 Python 프로그래밍, 리눅스 환경 실습 및 유전체 자료분석으로 구성된 12일 간의 유전체 정보분석 전문가 기본과정I 수강생을 모집하오니 많은 지원을 바랍니다.
일 시 : 2022년
7월
4일(월)
~ 2022년
7월
19일(화)
장 소 : 트레블로지 동대문 호텔 2층 미팅룸 (서울 중구 동호로 359)
주 최 : 한국보건복지인력개발원
주 관 : 서울대학교병원, 서울의대 정보의학실
인 원 : 35명 내외
등록비 : 무료
■ 일정별 프로그램
시간 |
7/4 (월) |
7/5 (화) |
7/6 (수) |
7/7 (목) |
7/8 (금) |
주제 |
R 통계학 |
R 통계학
|
NGS 자료처리
|
파이썬
|
파이썬
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9:00~
10:35 |
Starting with R
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Microarray data analysis I
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Germline Analysis Pipeline
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Starting with Python
|
Medical informatics practice 1
|
10:45~
12:15 |
Data manipulation
with R |
Microarray Data Analysis
II |
Genome assembly practice
I |
Data structure of python
|
Medical informatics practice
2 |
12:15~
13:15 |
중 식 |
주제 |
R 통계학 |
R 통계학
|
NGS 자료처리
|
파이썬
|
파이썬
|
13:15~
14:50 |
Statistical Analysis
I |
Classification using
R |
Genome assembly practice
II |
Functions of Python
|
Defining Class
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15:00~
16:35 |
Statistical Analysis
II |
Cell line Data at
GDSC & CCLE |
Genome annotation practice
|
Regular expression
|
Python machine learning
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16:45~
18:15 |
Advanced R graphics
|
Exploratory Data Analysis
and ggplot2 |
Evolution analysis practice
|
Bioinformatics Practice
|
Python visualization
|
시간 |
7/11 (월) |
7/12 (화) |
7/13 (수) |
7/14 (목) |
7/15 (금) |
주제 |
리눅스
프로그래밍 |
리눅스
프로그래밍 |
NGS 자료처리
|
R 통계학
|
엑솜 및 전장
유전체 |
9:00~
10:35 |
Linux file system
|
Linux Permission
|
PreProcessing
|
Reshaping data
and Cluster |
Germline calling
|
10:45~
12:15 |
Editing with VI
|
Linux Internet,
Network |
CellQC
with R |
Evaluation and Validation
|
Germline filtering/ Annotation
|
12:15~
13:15 |
중 식 |
주제 |
리눅스
프로그래밍 |
리눅스
프로그래밍 |
NGS 자료처리
|
R 통계학
|
엑솜 및 전장
유전체 |
13:15~
14:50 |
Linux Shell
Programming |
Linux Server
|
PostProcessing1
|
Advanced pathway analysis
|
Somatic calling
|
15:00~
16:35 |
Linux Operation
|
Linux Multitasking and Cluster
|
PostProcessing2
|
Survival analysis
|
Somatic Filtering/ Annotation
|
16:45~
18:15 |
Advanced Programming
|
Linux LVM
|
Interpretation
|
Case study
|
CNV
|
시간 |
7/18 (월) |
7/19 (화) |
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|
|
주제 |
엑솜 및 전장
유전체 |
전사체
후성유전체 |
|
|
|
9:00~
10:35 |
Cancer Genome Analysis
|
Non-coding RNA Analysis
|
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|
10:45~
12:15 |
Somatic Variant Detection
Gene Fusion Analysis |
RNA-Seq Gene Expression
Analysis |
|
|
|
12:15~
13:15 |
중 식 |
주제 |
엑솜 및 전장
유전체 |
전사체
후성유전체 |
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|
13:15~
14:50 |
Advanced Cancer Genome
Data Analysis |
Sequence-level
Transcriptome Analysis |
|
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15:00~
16:35 |
Somatic CNV detection
|
Epigenome Data Analysis
|
|
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16:45~
18:15 |
Multiomics and
Precision Medicine |
Epigenome Tools & Databases
Visualization of DNA Methylation Data |
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교육대상:
(1) BT·IT 혹은 의학분야 전공 학부 졸업생, 관련 석·박사과정 및 학위 소지자
(2) 의료기관 및 공공기관, 연구중심병원, 유전체분석 업체 취업 희망자
(3) 유전체 관련 기업, 연구소 등 재직자 및 창업 (준비)자
지원절차:
서류 전형 및 합격자 개별 통지
원서교부 및 접수기간 : 2022.6.15 ~ 2022.6.23
제출서류 : 아래 첨부한 지원서 양식을 다운로드 받아 일괄 작성하여 사무국에 제출
본 강의는 현장강의로 진행합니다.
사무국 : 02-740-8854 송민주 (bdpm.office@gmail.com)
홈페이지 : http://bitec.snubi.org/course9.html
지원방법 : 이메일 제출(우편 접수 불가)
합격자 발표일시 : 2022.6.28 (예정)
지원서 다운로드(한글)
지원서 다운로드(워드)
■ 실습 컴퓨터
강의실에 개인 컴퓨터가 없으므로, 실습 시 개인노트북 반드시 지참 (CPU i5 이상, RAM 16GB 이상 권장)
Apple M1칩 노트북의 경우, 프로그램 호환성 문제로 일부 실습 프로그램은 지원이 안될 수 있습니다.
장 소 : 트레블로지 동대문 호텔 2층 미팅룸 (서울 중구 동호로 359)
교 통 : 5호선 동대문역사문화공원역 7번 출구에서 320m
2호선 을지로4가역 7번 출구에서 340m
주 차 : 주차권을 판매하지 않는 관계로 가급적 대중교통을 이용하시기 바랍니다.
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